石材在使用過程中，或多或少都會受到不同程度的污染，問題主要有三方面：一是石材內部的一些物質成份與大氣中的物質發生化學反應而形成的；而二是日益嚴重的空氣污染所致；三是由于石材在安裝時施工方法不當所造成的。
　　一、銹斑銹斑
　　形成來自于兩方面：一是自然反應生成。因為石材內部的物質成份中都含有赤鐵礦和硫鐵礦，這些鐵質礦物接觸空氣被氧化而生成三氧化二鐵（鐵銹）后，通過石材的毛細孔滲出；二是因為石材在開采、加工、運輸、安裝、使用等過程中，不可避免的接觸到鐵制物品，這些鐵質物品的殘留沾敷在石材表面，被氧化后形成鐵銹污染。預防銹痕的關鍵是石材在安裝前必須采用樹脂注入的方法使石材具備防水功能，以防止石材內部的鐵質礦物被氧化后滲出石材表面。安裝后必須徹底清洗石材，防止石材因外界污染造成銹痕。在施工方法方面盡可能采用干掛方式，尤其是象美國白麻等一類較容易出現銹斑的石材，更應避免使用濕式施工方法，必要時可在安裝前做全方位的除銹和防水處理。處理已出現的銹痕，國內外主要的產品是除銹劑，理想的除銹劑應具備兩個條件：首先是除銹后的石材料不會再生銹；其次要求除銹劑本身不腐蝕石材，不影響石材表面光澤度。在除銹后，用清水徹底清洗，再用防護劑進行防護，使石材具有防水功能，以防日后其它病變的發生和由于化學腐蝕造成的麻煩。
　　二、濕痕不干
　　形成的主要原因是受濕式施工方法中的水泥沙漿影響所致。因為水泥的成份中含有1%~2%的氫氧化鈉.由于其對水份的吸附性很強，在潮濕的大氣中當環境溫度高于35度，立刻形成具有腐蝕性的碳酸鈉溶液。結晶水常因溫度的變化而變化，但永遠不會匱乏，這就形成了濕痕不干的現象。預防的方法主要是對石材進行防護，使石材料具有防水性，以此阻隔空氣中的水份與石材或水泥內部物質的接觸，降低其化學反應條件；其次應盡量避免采用水泥施工安裝屬材；最后還要切實做好填縫工程和排水工程。
　　三、鹽類晶化
　　這種現象主要是因屬于強堿性的水泥與大氣中的酸性溶液反應而成。碳酸鈉溶液通過石材的毛孔滲出到石材表面后，立刻與含有碳酸的潮氣進行中和反應，生成鹽類溶液，溶液中的水份干涸后，就形成鹽類晶化。遇水溶解就大面積出現。預防首先要盡可能避免采用濕式施工方法，其次用防護劑使石材具備防水性能。并切實做好填縫工程。
　　四、石灰剝蝕
　　這種現象出自于尚未被碳酸化的石灰溶液滲透到外墻表面，很快和大氣中的二氧化碳反應，生成不易水解的碳酸鈣，成為一層永久性的被覆層。這種現象主要發生在石材接縫處。
　　五、霜凍破壞
　　此類現象主要是因石材內部的毛細孔和裂痕所吸收的水份遇冷結冰所致。因為液態水結冰后體積膨脹率約在10%左右，這樣就對石材內部產生很大的壓力而脹裂石材。一些多孔的石材更易發生這類情況。
　　六、苔蘚植物的生長
　　現象主要發生在石材內部水份和有機質含量高的部位，它會導致石材變色，降低石材的強度和使用壽命。預防措施首先要做好排水工程避免積水；再加上應用防護劑，使石材具備良好的防水能。對已出現的苔蘚應先用工具將其鏟除，再用專業的清洗劑清潔，最好將石材做防護處理，防水并改善原有的排水設施。
　　七、化學腐蝕
　　這是由于工業廢氣家加上汽車排放的廢氣，使空氣中二氧化硫和三氧化硫的含量陡增的原因。溶于水中形成酸性溶液，可輕易地溶石材中的碳酸鈣，造成化學腐蝕。預防是施工前做好石材的防水，防止這些有害溶液進入石材。